Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 DNAH2-202ENST00000570791 2994 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 GPR55-205ENST00000622008 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 BTRC-203ENST00000393441 6084 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 HPS3-201ENST00000296051 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 CCT3-211ENST00000472765 1858 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 CHTF18-201ENST00000262315 3090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 TNFRSF8-203ENST00000417814 3593 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 ZNF202-207ENST00000530393 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 PCDHGA3-201ENST00000253812 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 TBC1D24-201ENST00000293970 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 FAM30A-205ENST00000630242 9612 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 LEPROTL1-201ENST00000321250 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 NCF2-201ENST00000367535 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 ZFAND3-203ENST00000373391 3001 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 MATN2-211ENST00000521689 3554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 LINC00442-202ENST00000456737 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 C19orf12-208ENST00000614091 4489 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.78□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 ITGB2-205ENST00000397850 3178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 SLC37A2-201ENST00000308074 2696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 TBC1D14-208ENST00000451522 4149 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 AL356275.1-201ENST00000638446 7440 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 FUT3-207ENST00000589620 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 SHMT2-201ENST00000328923 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 ANGPTL2-201ENST00000373417 2575 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 NTNG1-204ENST00000370067 4628 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 SLC44A4-210ENST00000544672 2634 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 EOGT-202ENST00000383701 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 ENOX1-201ENST00000261488 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 TMEM121B-202ENST00000399875 3961 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
LINC00587B1AMM8 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 COG4-202ENST00000393612 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 TEX35-204ENST00000367642 2452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 NCDN-201ENST00000356090 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 DYNC1I1-202ENST00000359388 2843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 CREB3L4-204ENST00000368603 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 NLRP2-201ENST00000263437 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
LINC00587B1AMM8 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms