Protein–RNA interactions for Protein: A6NKT7

RGPD3, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD3A6NKT7 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RGPD3A6NKT7 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RGPD3A6NKT7 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RGPD3A6NKT7 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
RGPD3A6NKT7 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
RGPD3A6NKT7 MME-218ENST00000625667 363 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RGPD3A6NKT7 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RGPD3A6NKT7 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RGPD3A6NKT7 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RGPD3A6NKT7 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RGPD3A6NKT7 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RGPD3A6NKT7 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RGPD3A6NKT7 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RGPD3A6NKT7 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RGPD3A6NKT7 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RGPD3A6NKT7 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RGPD3A6NKT7 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RGPD3A6NKT7 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RGPD3A6NKT7 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RGPD3A6NKT7 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RGPD3A6NKT7 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RGPD3A6NKT7 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RGPD3A6NKT7 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RGPD3A6NKT7 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RGPD3A6NKT7 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RGPD3A6NKT7 KRT17P4-201ENST00000429445 819 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
RGPD3A6NKT7 FAM86KP-201ENST00000509817 987 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
RGPD3A6NKT7 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RGPD3A6NKT7 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RGPD3A6NKT7 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RGPD3A6NKT7 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RGPD3A6NKT7 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RGPD3A6NKT7 HIST1H1D-201ENST00000244534 666 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RGPD3A6NKT7 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RGPD3A6NKT7 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RGPD3A6NKT7 UROS-201ENST00000368774 744 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RGPD3A6NKT7 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RGPD3A6NKT7 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RGPD3A6NKT7 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RGPD3A6NKT7 RNF216P1-212ENST00000493407 659 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RGPD3A6NKT7 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
RGPD3A6NKT7 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RGPD3A6NKT7 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RGPD3A6NKT7 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RGPD3A6NKT7 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RGPD3A6NKT7 C20orf96-202ENST00000382369 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RGPD3A6NKT7 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
RGPD3A6NKT7 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RGPD3A6NKT7 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RGPD3A6NKT7 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RGPD3A6NKT7 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RGPD3A6NKT7 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RGPD3A6NKT7 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RGPD3A6NKT7 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RGPD3A6NKT7 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RGPD3A6NKT7 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RGPD3A6NKT7 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RGPD3A6NKT7 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RGPD3A6NKT7 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RGPD3A6NKT7 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RGPD3A6NKT7 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RGPD3A6NKT7 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RGPD3A6NKT7 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RGPD3A6NKT7 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RGPD3A6NKT7 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RGPD3A6NKT7 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RGPD3A6NKT7 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RGPD3A6NKT7 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RGPD3A6NKT7 TTC23L-209ENST00000638320 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RGPD3A6NKT7 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RGPD3A6NKT7 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RGPD3A6NKT7 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RGPD3A6NKT7 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RGPD3A6NKT7 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RGPD3A6NKT7 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RGPD3A6NKT7 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RGPD3A6NKT7 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RGPD3A6NKT7 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RGPD3A6NKT7 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RGPD3A6NKT7 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RGPD3A6NKT7 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RGPD3A6NKT7 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RGPD3A6NKT7 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
RGPD3A6NKT7 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RGPD3A6NKT7 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RGPD3A6NKT7 LCE2C-201ENST00000368783 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RGPD3A6NKT7 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RGPD3A6NKT7 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
RGPD3A6NKT7 RAD51C-203ENST00000421782 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RGPD3A6NKT7 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RGPD3A6NKT7 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RGPD3A6NKT7 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RGPD3A6NKT7 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RGPD3A6NKT7 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
RGPD3A6NKT7 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
RGPD3A6NKT7 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RGPD3A6NKT7 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RGPD3A6NKT7 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RGPD3A6NKT7 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RGPD3A6NKT7 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms