Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D8

HECTD4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HECTD4, humanhuman

Predictions only

Length 3,996 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD4Q9Y4D8 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC10.04□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 AC003982.2-201ENST00000536933 365 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 AC093567.1-201ENST00000590649 877 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 REEP5-205ENST00000504247 480 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 AC104333.4-201ENST00000632866 554 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 CRHR1-205ENST00000352855 1146 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 EMP1-203ENST00000431267 1039 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 RNF216P1-212ENST00000493407 659 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 LINC01278-201ENST00000433061 529 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 LINC01278-206ENST00000610088 554 ntTSL 4 BASIC10.03□□□□□ -0.8
HECTD4Q9Y4D8 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms