Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC3

RAB23, Ras-related protein Rab-23, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB23Q9ULC3 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB23Q9ULC3 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms