Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK8

MTRR, Methionine synthase reductase, humanhuman

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTRRQ9UBK8 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MTRRQ9UBK8 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MTRRQ9UBK8 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MTRRQ9UBK8 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MTRRQ9UBK8 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MTRRQ9UBK8 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MTRRQ9UBK8 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MTRRQ9UBK8 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MTRRQ9UBK8 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MTRRQ9UBK8 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MTRRQ9UBK8 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MTRRQ9UBK8 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MTRRQ9UBK8 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MTRRQ9UBK8 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MTRRQ9UBK8 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MTRRQ9UBK8 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MTRRQ9UBK8 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MTRRQ9UBK8 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MTRRQ9UBK8 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MTRRQ9UBK8 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MTRRQ9UBK8 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MTRRQ9UBK8 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MTRRQ9UBK8 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MTRRQ9UBK8 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MTRRQ9UBK8 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MTRRQ9UBK8 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MTRRQ9UBK8 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MTRRQ9UBK8 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MTRRQ9UBK8 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MTRRQ9UBK8 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MTRRQ9UBK8 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MTRRQ9UBK8 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MTRRQ9UBK8 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MTRRQ9UBK8 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MTRRQ9UBK8 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MTRRQ9UBK8 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MTRRQ9UBK8 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MTRRQ9UBK8 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MTRRQ9UBK8 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MTRRQ9UBK8 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MTRRQ9UBK8 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MTRRQ9UBK8 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MTRRQ9UBK8 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MTRRQ9UBK8 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MTRRQ9UBK8 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MTRRQ9UBK8 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MTRRQ9UBK8 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MTRRQ9UBK8 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MTRRQ9UBK8 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MTRRQ9UBK8 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MTRRQ9UBK8 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MTRRQ9UBK8 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
MTRRQ9UBK8 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MTRRQ9UBK8 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
MTRRQ9UBK8 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MTRRQ9UBK8 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MTRRQ9UBK8 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MTRRQ9UBK8 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MTRRQ9UBK8 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MTRRQ9UBK8 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MTRRQ9UBK8 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MTRRQ9UBK8 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MTRRQ9UBK8 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MTRRQ9UBK8 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MTRRQ9UBK8 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MTRRQ9UBK8 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MTRRQ9UBK8 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MTRRQ9UBK8 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MTRRQ9UBK8 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MTRRQ9UBK8 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MTRRQ9UBK8 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MTRRQ9UBK8 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MTRRQ9UBK8 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
MTRRQ9UBK8 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
MTRRQ9UBK8 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MTRRQ9UBK8 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MTRRQ9UBK8 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MTRRQ9UBK8 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
MTRRQ9UBK8 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MTRRQ9UBK8 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MTRRQ9UBK8 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MTRRQ9UBK8 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MTRRQ9UBK8 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MTRRQ9UBK8 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MTRRQ9UBK8 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MTRRQ9UBK8 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MTRRQ9UBK8 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MTRRQ9UBK8 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MTRRQ9UBK8 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MTRRQ9UBK8 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MTRRQ9UBK8 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
MTRRQ9UBK8 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MTRRQ9UBK8 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MTRRQ9UBK8 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MTRRQ9UBK8 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MTRRQ9UBK8 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MTRRQ9UBK8 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MTRRQ9UBK8 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MTRRQ9UBK8 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MTRRQ9UBK8 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms