Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBD3

XCL2, Cytokine SCM-1 beta, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCL2Q9UBD3 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC11.64□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC11.64□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.63□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC11.63□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
XCL2Q9UBD3 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms