Protein–RNA interactions for Protein: Q9P275

USP36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36Q9P275 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP36Q9P275 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms