Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXS3

KLHL28, Kelch-like protein 28, humanhuman

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Length 571 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL28Q9NXS3 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
KLHL28Q9NXS3 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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