Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRB3

CHST12, Carbohydrate sulfotransferase 12, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST12Q9NRB3 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHST12Q9NRB3 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms