Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C7

AMBRA1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMBRA1Q9C0C7 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AMBRA1Q9C0C7 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AMBRA1Q9C0C7 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
AMBRA1Q9C0C7 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
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AMBRA1Q9C0C7 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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AMBRA1Q9C0C7 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AMBRA1Q9C0C7 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
AMBRA1Q9C0C7 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
AMBRA1Q9C0C7 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
AMBRA1Q9C0C7 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AMBRA1Q9C0C7 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AMBRA1Q9C0C7 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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AMBRA1Q9C0C7 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AMBRA1Q9C0C7 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AMBRA1Q9C0C7 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
AMBRA1Q9C0C7 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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AMBRA1Q9C0C7 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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AMBRA1Q9C0C7 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AMBRA1Q9C0C7 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AMBRA1Q9C0C7 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AMBRA1Q9C0C7 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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AMBRA1Q9C0C7 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AMBRA1Q9C0C7 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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AMBRA1Q9C0C7 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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AMBRA1Q9C0C7 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AMBRA1Q9C0C7 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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