Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY41

HDAC8, Histone deacetylase 8, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC8Q9BY41 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HDAC8Q9BY41 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms