Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE2

TMEM79, Transmembrane protein 79, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM79Q9BSE2 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM79Q9BSE2 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM79Q9BSE2 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM79Q9BSE2 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM79Q9BSE2 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM79Q9BSE2 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM79Q9BSE2 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM79Q9BSE2 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM79Q9BSE2 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM79Q9BSE2 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM79Q9BSE2 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM79Q9BSE2 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM79Q9BSE2 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM79Q9BSE2 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM79Q9BSE2 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM79Q9BSE2 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM79Q9BSE2 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM79Q9BSE2 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM79Q9BSE2 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM79Q9BSE2 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM79Q9BSE2 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM79Q9BSE2 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM79Q9BSE2 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM79Q9BSE2 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM79Q9BSE2 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM79Q9BSE2 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM79Q9BSE2 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM79Q9BSE2 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM79Q9BSE2 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM79Q9BSE2 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM79Q9BSE2 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM79Q9BSE2 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM79Q9BSE2 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM79Q9BSE2 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM79Q9BSE2 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM79Q9BSE2 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM79Q9BSE2 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM79Q9BSE2 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM79Q9BSE2 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM79Q9BSE2 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM79Q9BSE2 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM79Q9BSE2 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM79Q9BSE2 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM79Q9BSE2 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM79Q9BSE2 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM79Q9BSE2 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM79Q9BSE2 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM79Q9BSE2 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM79Q9BSE2 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM79Q9BSE2 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM79Q9BSE2 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM79Q9BSE2 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM79Q9BSE2 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM79Q9BSE2 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM79Q9BSE2 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM79Q9BSE2 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM79Q9BSE2 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM79Q9BSE2 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM79Q9BSE2 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM79Q9BSE2 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM79Q9BSE2 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM79Q9BSE2 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM79Q9BSE2 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM79Q9BSE2 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM79Q9BSE2 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM79Q9BSE2 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM79Q9BSE2 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM79Q9BSE2 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM79Q9BSE2 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM79Q9BSE2 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM79Q9BSE2 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM79Q9BSE2 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM79Q9BSE2 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM79Q9BSE2 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM79Q9BSE2 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM79Q9BSE2 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM79Q9BSE2 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM79Q9BSE2 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM79Q9BSE2 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM79Q9BSE2 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM79Q9BSE2 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM79Q9BSE2 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM79Q9BSE2 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM79Q9BSE2 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM79Q9BSE2 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM79Q9BSE2 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM79Q9BSE2 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM79Q9BSE2 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM79Q9BSE2 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM79Q9BSE2 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM79Q9BSE2 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM79Q9BSE2 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM79Q9BSE2 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM79Q9BSE2 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM79Q9BSE2 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM79Q9BSE2 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM79Q9BSE2 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM79Q9BSE2 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM79Q9BSE2 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM79Q9BSE2 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms