Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FYCO1Q9BQS8 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
FYCO1Q9BQS8 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FYCO1Q9BQS8 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FYCO1Q9BQS8 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FYCO1Q9BQS8 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FYCO1Q9BQS8 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FYCO1Q9BQS8 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FYCO1Q9BQS8 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FYCO1Q9BQS8 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FYCO1Q9BQS8 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FYCO1Q9BQS8 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FYCO1Q9BQS8 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FYCO1Q9BQS8 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
FYCO1Q9BQS8 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FYCO1Q9BQS8 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FYCO1Q9BQS8 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FYCO1Q9BQS8 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FYCO1Q9BQS8 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FYCO1Q9BQS8 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FYCO1Q9BQS8 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FYCO1Q9BQS8 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FYCO1Q9BQS8 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FYCO1Q9BQS8 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FYCO1Q9BQS8 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FYCO1Q9BQS8 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FYCO1Q9BQS8 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FYCO1Q9BQS8 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FYCO1Q9BQS8 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FYCO1Q9BQS8 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FYCO1Q9BQS8 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FYCO1Q9BQS8 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FYCO1Q9BQS8 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FYCO1Q9BQS8 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FYCO1Q9BQS8 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FYCO1Q9BQS8 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FYCO1Q9BQS8 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FYCO1Q9BQS8 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
FYCO1Q9BQS8 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
FYCO1Q9BQS8 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FYCO1Q9BQS8 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FYCO1Q9BQS8 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FYCO1Q9BQS8 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FYCO1Q9BQS8 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FYCO1Q9BQS8 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FYCO1Q9BQS8 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FYCO1Q9BQS8 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
FYCO1Q9BQS8 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FYCO1Q9BQS8 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FYCO1Q9BQS8 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FYCO1Q9BQS8 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FYCO1Q9BQS8 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FYCO1Q9BQS8 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FYCO1Q9BQS8 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FYCO1Q9BQS8 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FYCO1Q9BQS8 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FYCO1Q9BQS8 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FYCO1Q9BQS8 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
FYCO1Q9BQS8 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FYCO1Q9BQS8 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FYCO1Q9BQS8 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FYCO1Q9BQS8 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FYCO1Q9BQS8 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FYCO1Q9BQS8 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FYCO1Q9BQS8 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FYCO1Q9BQS8 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FYCO1Q9BQS8 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FYCO1Q9BQS8 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FYCO1Q9BQS8 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FYCO1Q9BQS8 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FYCO1Q9BQS8 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FYCO1Q9BQS8 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FYCO1Q9BQS8 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FYCO1Q9BQS8 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FYCO1Q9BQS8 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
FYCO1Q9BQS8 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FYCO1Q9BQS8 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
FYCO1Q9BQS8 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FYCO1Q9BQS8 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FYCO1Q9BQS8 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FYCO1Q9BQS8 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FYCO1Q9BQS8 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FYCO1Q9BQS8 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FYCO1Q9BQS8 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FYCO1Q9BQS8 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FYCO1Q9BQS8 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FYCO1Q9BQS8 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FYCO1Q9BQS8 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
FYCO1Q9BQS8 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FYCO1Q9BQS8 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FYCO1Q9BQS8 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
FYCO1Q9BQS8 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FYCO1Q9BQS8 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FYCO1Q9BQS8 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FYCO1Q9BQS8 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FYCO1Q9BQS8 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FYCO1Q9BQS8 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
FYCO1Q9BQS8 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FYCO1Q9BQS8 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
FYCO1Q9BQS8 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms