Protein–RNA interactions for Protein: Q99453

PHOX2B, Paired mesoderm homeobox protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2BQ99453 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHOX2BQ99453 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHOX2BQ99453 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHOX2BQ99453 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHOX2BQ99453 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHOX2BQ99453 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHOX2BQ99453 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHOX2BQ99453 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PHOX2BQ99453 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHOX2BQ99453 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHOX2BQ99453 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHOX2BQ99453 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PHOX2BQ99453 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHOX2BQ99453 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHOX2BQ99453 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHOX2BQ99453 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHOX2BQ99453 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHOX2BQ99453 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHOX2BQ99453 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHOX2BQ99453 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHOX2BQ99453 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHOX2BQ99453 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHOX2BQ99453 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHOX2BQ99453 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHOX2BQ99453 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHOX2BQ99453 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHOX2BQ99453 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHOX2BQ99453 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHOX2BQ99453 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHOX2BQ99453 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PHOX2BQ99453 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHOX2BQ99453 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHOX2BQ99453 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHOX2BQ99453 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHOX2BQ99453 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PHOX2BQ99453 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHOX2BQ99453 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PHOX2BQ99453 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHOX2BQ99453 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHOX2BQ99453 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PHOX2BQ99453 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHOX2BQ99453 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHOX2BQ99453 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PHOX2BQ99453 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHOX2BQ99453 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHOX2BQ99453 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHOX2BQ99453 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHOX2BQ99453 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHOX2BQ99453 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHOX2BQ99453 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHOX2BQ99453 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHOX2BQ99453 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PHOX2BQ99453 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHOX2BQ99453 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHOX2BQ99453 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHOX2BQ99453 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHOX2BQ99453 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHOX2BQ99453 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHOX2BQ99453 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHOX2BQ99453 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PHOX2BQ99453 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PHOX2BQ99453 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHOX2BQ99453 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHOX2BQ99453 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHOX2BQ99453 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHOX2BQ99453 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHOX2BQ99453 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHOX2BQ99453 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHOX2BQ99453 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHOX2BQ99453 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHOX2BQ99453 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHOX2BQ99453 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHOX2BQ99453 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHOX2BQ99453 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHOX2BQ99453 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHOX2BQ99453 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PHOX2BQ99453 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHOX2BQ99453 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHOX2BQ99453 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHOX2BQ99453 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHOX2BQ99453 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PHOX2BQ99453 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHOX2BQ99453 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHOX2BQ99453 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHOX2BQ99453 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHOX2BQ99453 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHOX2BQ99453 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHOX2BQ99453 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHOX2BQ99453 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PHOX2BQ99453 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHOX2BQ99453 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHOX2BQ99453 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHOX2BQ99453 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHOX2BQ99453 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHOX2BQ99453 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHOX2BQ99453 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHOX2BQ99453 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHOX2BQ99453 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHOX2BQ99453 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PHOX2BQ99453 AL355994.1-201ENST00000424379 260 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms