Protein–RNA interactions for Protein: Q96F63

CCDC97, Coiled-coil domain-containing protein 97, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC97Q96F63 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 PPFIA4-204ENST00000447715 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 IGF2BP1-201ENST00000290341 8274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 CEP68-202ENST00000377990 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 RN7SL121P-201ENST00000584223 273 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 IKZF1-204ENST00000349824 5757 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 RIMBP2-201ENST00000261655 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 SLC4A7-203ENST00000425128 7970 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms