Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
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GTF3C6Q969F1 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
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GTF3C6Q969F1 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
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GTF3C6Q969F1 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
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GTF3C6Q969F1 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
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GTF3C6Q969F1 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
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