Protein–RNA interactions for Protein: Q92772

CDKL2, Cyclin-dependent kinase-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL2Q92772 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDKL2Q92772 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDKL2Q92772 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDKL2Q92772 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDKL2Q92772 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CDKL2Q92772 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CDKL2Q92772 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDKL2Q92772 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDKL2Q92772 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDKL2Q92772 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDKL2Q92772 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDKL2Q92772 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDKL2Q92772 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDKL2Q92772 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDKL2Q92772 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDKL2Q92772 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CDKL2Q92772 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDKL2Q92772 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDKL2Q92772 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDKL2Q92772 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDKL2Q92772 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDKL2Q92772 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDKL2Q92772 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDKL2Q92772 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDKL2Q92772 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDKL2Q92772 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDKL2Q92772 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDKL2Q92772 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDKL2Q92772 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDKL2Q92772 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDKL2Q92772 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDKL2Q92772 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDKL2Q92772 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDKL2Q92772 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CDKL2Q92772 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKL2Q92772 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKL2Q92772 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKL2Q92772 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKL2Q92772 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKL2Q92772 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKL2Q92772 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKL2Q92772 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKL2Q92772 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKL2Q92772 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKL2Q92772 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKL2Q92772 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKL2Q92772 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKL2Q92772 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKL2Q92772 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKL2Q92772 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKL2Q92772 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKL2Q92772 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKL2Q92772 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKL2Q92772 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKL2Q92772 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKL2Q92772 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKL2Q92772 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKL2Q92772 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKL2Q92772 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKL2Q92772 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKL2Q92772 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKL2Q92772 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKL2Q92772 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKL2Q92772 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKL2Q92772 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKL2Q92772 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKL2Q92772 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKL2Q92772 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKL2Q92772 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKL2Q92772 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKL2Q92772 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKL2Q92772 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKL2Q92772 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKL2Q92772 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKL2Q92772 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKL2Q92772 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKL2Q92772 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKL2Q92772 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKL2Q92772 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKL2Q92772 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKL2Q92772 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKL2Q92772 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKL2Q92772 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKL2Q92772 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKL2Q92772 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKL2Q92772 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKL2Q92772 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDKL2Q92772 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDKL2Q92772 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDKL2Q92772 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDKL2Q92772 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDKL2Q92772 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDKL2Q92772 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDKL2Q92772 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDKL2Q92772 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDKL2Q92772 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDKL2Q92772 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDKL2Q92772 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDKL2Q92772 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDKL2Q92772 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms