Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

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Length 508 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
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UBXN4Q92575 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
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UBXN4Q92575 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
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UBXN4Q92575 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
UBXN4Q92575 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
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