Protein–RNA interactions for Protein: Q92542

NCSTN, Nicastrin, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCSTNQ92542 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms