Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC12Q8WUD4 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC12Q8WUD4 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms