Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4P3

HDDC3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, humanhuman

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Length 179 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDDC3Q8N4P3 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HDDC3Q8N4P3 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
HDDC3Q8N4P3 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HDDC3Q8N4P3 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HDDC3Q8N4P3 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HDDC3Q8N4P3 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HDDC3Q8N4P3 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HDDC3Q8N4P3 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
HDDC3Q8N4P3 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HDDC3Q8N4P3 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HDDC3Q8N4P3 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HDDC3Q8N4P3 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HDDC3Q8N4P3 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HDDC3Q8N4P3 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HDDC3Q8N4P3 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HDDC3Q8N4P3 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HDDC3Q8N4P3 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
HDDC3Q8N4P3 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HDDC3Q8N4P3 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HDDC3Q8N4P3 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HDDC3Q8N4P3 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HDDC3Q8N4P3 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HDDC3Q8N4P3 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HDDC3Q8N4P3 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HDDC3Q8N4P3 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HDDC3Q8N4P3 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HDDC3Q8N4P3 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HDDC3Q8N4P3 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HDDC3Q8N4P3 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HDDC3Q8N4P3 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HDDC3Q8N4P3 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
HDDC3Q8N4P3 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
HDDC3Q8N4P3 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
HDDC3Q8N4P3 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HDDC3Q8N4P3 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
HDDC3Q8N4P3 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HDDC3Q8N4P3 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
HDDC3Q8N4P3 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HDDC3Q8N4P3 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HDDC3Q8N4P3 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HDDC3Q8N4P3 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HDDC3Q8N4P3 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HDDC3Q8N4P3 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HDDC3Q8N4P3 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HDDC3Q8N4P3 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HDDC3Q8N4P3 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HDDC3Q8N4P3 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HDDC3Q8N4P3 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HDDC3Q8N4P3 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HDDC3Q8N4P3 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HDDC3Q8N4P3 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HDDC3Q8N4P3 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HDDC3Q8N4P3 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HDDC3Q8N4P3 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HDDC3Q8N4P3 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HDDC3Q8N4P3 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HDDC3Q8N4P3 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HDDC3Q8N4P3 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
HDDC3Q8N4P3 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
HDDC3Q8N4P3 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HDDC3Q8N4P3 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HDDC3Q8N4P3 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HDDC3Q8N4P3 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HDDC3Q8N4P3 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HDDC3Q8N4P3 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HDDC3Q8N4P3 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
HDDC3Q8N4P3 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
HDDC3Q8N4P3 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HDDC3Q8N4P3 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HDDC3Q8N4P3 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HDDC3Q8N4P3 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HDDC3Q8N4P3 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HDDC3Q8N4P3 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HDDC3Q8N4P3 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HDDC3Q8N4P3 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HDDC3Q8N4P3 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HDDC3Q8N4P3 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HDDC3Q8N4P3 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HDDC3Q8N4P3 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
HDDC3Q8N4P3 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HDDC3Q8N4P3 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HDDC3Q8N4P3 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HDDC3Q8N4P3 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HDDC3Q8N4P3 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HDDC3Q8N4P3 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HDDC3Q8N4P3 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HDDC3Q8N4P3 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HDDC3Q8N4P3 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HDDC3Q8N4P3 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HDDC3Q8N4P3 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HDDC3Q8N4P3 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HDDC3Q8N4P3 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HDDC3Q8N4P3 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HDDC3Q8N4P3 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HDDC3Q8N4P3 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HDDC3Q8N4P3 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HDDC3Q8N4P3 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HDDC3Q8N4P3 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HDDC3Q8N4P3 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HDDC3Q8N4P3 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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