Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC84Q86UT8 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC84Q86UT8 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.8 ms