Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU9

STRC, Stereocilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCQ7RTU9 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
STRCQ7RTU9 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
STRCQ7RTU9 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
STRCQ7RTU9 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
STRCQ7RTU9 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
STRCQ7RTU9 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
STRCQ7RTU9 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
STRCQ7RTU9 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
STRCQ7RTU9 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
STRCQ7RTU9 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
STRCQ7RTU9 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
STRCQ7RTU9 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
STRCQ7RTU9 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC21.28■■□□□ 1
STRCQ7RTU9 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
STRCQ7RTU9 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC21.28■■□□□ 1
STRCQ7RTU9 ZNRD1-203ENST00000376782 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
STRCQ7RTU9 KCNE1-203ENST00000399286 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
STRCQ7RTU9 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
STRCQ7RTU9 AC093826.1-201ENST00000508655 993 ntBASIC21.28■■□□□ 1
STRCQ7RTU9 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
STRCQ7RTU9 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC21.28■■□□□ 1
STRCQ7RTU9 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
STRCQ7RTU9 AC130456.3-201ENST00000561762 633 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
STRCQ7RTU9 SLC9A3R2-204ENST00000563587 1037 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
STRCQ7RTU9 AL590235.1-201ENST00000564650 861 ntBASIC21.28■■□□□ 1
STRCQ7RTU9 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC21.28■■□□□ 1
STRCQ7RTU9 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
STRCQ7RTU9 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
STRCQ7RTU9 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
STRCQ7RTU9 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
STRCQ7RTU9 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
STRCQ7RTU9 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
STRCQ7RTU9 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
STRCQ7RTU9 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
STRCQ7RTU9 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC21.28■■□□□ 1
STRCQ7RTU9 OR2K2-201ENST00000302681 1078 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
STRCQ7RTU9 KCNK9-201ENST00000303015 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
STRCQ7RTU9 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
STRCQ7RTU9 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
STRCQ7RTU9 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC21.28■■□□□ 1
STRCQ7RTU9 RPL9-203ENST00000449470 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
STRCQ7RTU9 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
STRCQ7RTU9 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
STRCQ7RTU9 CYP4F36P-201ENST00000589193 186 ntBASIC21.28■■□□□ 1
STRCQ7RTU9 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC21.28■■□□□ 1
STRCQ7RTU9 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
STRCQ7RTU9 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
STRCQ7RTU9 LAMP5-202ENST00000427562 1309 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
STRCQ7RTU9 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
STRCQ7RTU9 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
STRCQ7RTU9 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
STRCQ7RTU9 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
STRCQ7RTU9 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
STRCQ7RTU9 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
STRCQ7RTU9 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
STRCQ7RTU9 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
STRCQ7RTU9 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
STRCQ7RTU9 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
STRCQ7RTU9 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
STRCQ7RTU9 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
STRCQ7RTU9 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC21.27■■□□□ 1
STRCQ7RTU9 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
STRCQ7RTU9 RGR-203ENST00000372092 868 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
STRCQ7RTU9 CYB561D1-203ENST00000393709 620 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
STRCQ7RTU9 AF274858.1-201ENST00000406288 372 ntBASIC21.27■■□□□ 1
STRCQ7RTU9 LINC00339-202ENST00000416769 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
STRCQ7RTU9 NAA60-205ENST00000424546 1149 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
STRCQ7RTU9 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
STRCQ7RTU9 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
STRCQ7RTU9 TREHP1-201ENST00000531328 465 ntBASIC21.27■■□□□ 1
STRCQ7RTU9 AC006483.2-201ENST00000609813 515 ntBASIC21.27■■□□□ 1
STRCQ7RTU9 AC010503.4-201ENST00000615487 688 ntBASIC21.27■■□□□ 1
STRCQ7RTU9 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
STRCQ7RTU9 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC21.27■■□□□ 1
STRCQ7RTU9 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
STRCQ7RTU9 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
STRCQ7RTU9 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
STRCQ7RTU9 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
STRCQ7RTU9 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
STRCQ7RTU9 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
STRCQ7RTU9 ATP5H-202ENST00000344546 553 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
STRCQ7RTU9 IFI35-204ENST00000438323 1232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
STRCQ7RTU9 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
STRCQ7RTU9 AC113391.2-201ENST00000512245 553 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
STRCQ7RTU9 AC022858.1-202ENST00000521084 393 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
STRCQ7RTU9 AP004550.1-201ENST00000532652 514 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
STRCQ7RTU9 AC007656.1-201ENST00000552238 573 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
STRCQ7RTU9 APOPT1-215ENST00000556253 783 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
STRCQ7RTU9 AC012617.1-201ENST00000586345 797 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
STRCQ7RTU9 FXYD3-204ENST00000603181 758 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
STRCQ7RTU9 MIR6125-201ENST00000618986 96 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
STRCQ7RTU9 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
STRCQ7RTU9 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
STRCQ7RTU9 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
STRCQ7RTU9 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
STRCQ7RTU9 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
STRCQ7RTU9 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
STRCQ7RTU9 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
STRCQ7RTU9 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
STRCQ7RTU9 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms