Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ2

USP34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, humanhuman

Predictions only

Length 3,546 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP34Q70CQ2 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP34Q70CQ2 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP34Q70CQ2 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP34Q70CQ2 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
USP34Q70CQ2 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP34Q70CQ2 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP34Q70CQ2 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP34Q70CQ2 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP34Q70CQ2 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
USP34Q70CQ2 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
USP34Q70CQ2 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 EHMT2-AS1-201ENST00000434689 373 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 C2orf69P1-201ENST00000563532 1093 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 AC138466.4-201ENST00000623965 852 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 TTPAL-203ENST00000372906 1139 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 FAM27E5-201ENST00000426869 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 PRKAR2A-AS1-203ENST00000431705 592 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 TMBIM4-208ENST00000542724 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
USP34Q70CQ2 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms