Protein–RNA interactions for Protein: Q6P435

Putative uncharacterized SMG1-like protein, humanhuman

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6P435 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q6P435 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q6P435 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q6P435 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q6P435 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q6P435 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q6P435 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q6P435 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q6P435 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q6P435 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q6P435 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q6P435 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q6P435 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Q6P435 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q6P435 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q6P435 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q6P435 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Q6P435 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q6P435 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Q6P435 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q6P435 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Q6P435 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Q6P435 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q6P435 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q6P435 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q6P435 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q6P435 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q6P435 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q6P435 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Q6P435 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Q6P435 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q6P435 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q6P435 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q6P435 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q6P435 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q6P435 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q6P435 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q6P435 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q6P435 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q6P435 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q6P435 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q6P435 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q6P435 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q6P435 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q6P435 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q6P435 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Q6P435 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Q6P435 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Q6P435 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Q6P435 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Q6P435 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Q6P435 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Q6P435 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Q6P435 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Q6P435 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Q6P435 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Q6P435 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Q6P435 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q6P435 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q6P435 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q6P435 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q6P435 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q6P435 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q6P435 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q6P435 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q6P435 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q6P435 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Q6P435 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q6P435 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q6P435 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q6P435 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Q6P435 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q6P435 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q6P435 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q6P435 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q6P435 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q6P435 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q6P435 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Q6P435 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q6P435 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q6P435 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q6P435 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q6P435 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q6P435 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q6P435 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Q6P435 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q6P435 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Q6P435 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q6P435 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q6P435 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q6P435 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q6P435 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q6P435 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Q6P435 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q6P435 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q6P435 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q6P435 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q6P435 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q6P435 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q6P435 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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