Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPR1

ETFRF1, Electron transfer flavoprotein regulatory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 90 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETFRF1Q6IPR1 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ETFRF1Q6IPR1 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ETFRF1Q6IPR1 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ETFRF1Q6IPR1 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ETFRF1Q6IPR1 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ETFRF1Q6IPR1 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ETFRF1Q6IPR1 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ETFRF1Q6IPR1 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ETFRF1Q6IPR1 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ETFRF1Q6IPR1 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ETFRF1Q6IPR1 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ETFRF1Q6IPR1 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ETFRF1Q6IPR1 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ETFRF1Q6IPR1 PPP3CA-202ENST00000394853 3604 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ETFRF1Q6IPR1 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ETFRF1Q6IPR1 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ETFRF1Q6IPR1 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ETFRF1Q6IPR1 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ETFRF1Q6IPR1 AMER2-201ENST00000357816 10055 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ETFRF1Q6IPR1 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ETFRF1Q6IPR1 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ETFRF1Q6IPR1 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
ETFRF1Q6IPR1 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ETFRF1Q6IPR1 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ETFRF1Q6IPR1 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ETFRF1Q6IPR1 XPOT-201ENST00000332707 6414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ETFRF1Q6IPR1 GRM1-204ENST00000492807 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ETFRF1Q6IPR1 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ETFRF1Q6IPR1 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ETFRF1Q6IPR1 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ETFRF1Q6IPR1 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ETFRF1Q6IPR1 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ETFRF1Q6IPR1 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
ETFRF1Q6IPR1 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ETFRF1Q6IPR1 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ETFRF1Q6IPR1 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ETFRF1Q6IPR1 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
ETFRF1Q6IPR1 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ETFRF1Q6IPR1 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ETFRF1Q6IPR1 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ETFRF1Q6IPR1 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ETFRF1Q6IPR1 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ETFRF1Q6IPR1 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ETFRF1Q6IPR1 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
ETFRF1Q6IPR1 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ETFRF1Q6IPR1 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ETFRF1Q6IPR1 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
ETFRF1Q6IPR1 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
ETFRF1Q6IPR1 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ETFRF1Q6IPR1 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ETFRF1Q6IPR1 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ETFRF1Q6IPR1 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ETFRF1Q6IPR1 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ETFRF1Q6IPR1 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ETFRF1Q6IPR1 LHFPL2-201ENST00000380345 5043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ETFRF1Q6IPR1 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ETFRF1Q6IPR1 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ETFRF1Q6IPR1 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ETFRF1Q6IPR1 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ETFRF1Q6IPR1 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ETFRF1Q6IPR1 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ETFRF1Q6IPR1 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ETFRF1Q6IPR1 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ETFRF1Q6IPR1 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ETFRF1Q6IPR1 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ETFRF1Q6IPR1 DOCK4-206ENST00000437633 6212 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ETFRF1Q6IPR1 SFRP1-202ENST00000379845 3873 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ETFRF1Q6IPR1 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ETFRF1Q6IPR1 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ETFRF1Q6IPR1 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ETFRF1Q6IPR1 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ETFRF1Q6IPR1 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ETFRF1Q6IPR1 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ETFRF1Q6IPR1 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ETFRF1Q6IPR1 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ETFRF1Q6IPR1 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ETFRF1Q6IPR1 DLX3-201ENST00000434704 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ETFRF1Q6IPR1 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ETFRF1Q6IPR1 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ETFRF1Q6IPR1 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ETFRF1Q6IPR1 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ETFRF1Q6IPR1 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ETFRF1Q6IPR1 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
ETFRF1Q6IPR1 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ETFRF1Q6IPR1 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ETFRF1Q6IPR1 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ETFRF1Q6IPR1 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
ETFRF1Q6IPR1 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ETFRF1Q6IPR1 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ETFRF1Q6IPR1 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ETFRF1Q6IPR1 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ETFRF1Q6IPR1 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ETFRF1Q6IPR1 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ETFRF1Q6IPR1 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ETFRF1Q6IPR1 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ETFRF1Q6IPR1 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ETFRF1Q6IPR1 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ETFRF1Q6IPR1 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ETFRF1Q6IPR1 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ETFRF1Q6IPR1 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms