Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CARMIL2Q6F5E8 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CARMIL2Q6F5E8 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CARMIL2Q6F5E8 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CARMIL2Q6F5E8 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CARMIL2Q6F5E8 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CARMIL2Q6F5E8 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CARMIL2Q6F5E8 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CARMIL2Q6F5E8 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CARMIL2Q6F5E8 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CARMIL2Q6F5E8 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CARMIL2Q6F5E8 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CARMIL2Q6F5E8 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CARMIL2Q6F5E8 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CARMIL2Q6F5E8 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CARMIL2Q6F5E8 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CARMIL2Q6F5E8 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CARMIL2Q6F5E8 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CARMIL2Q6F5E8 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CARMIL2Q6F5E8 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CARMIL2Q6F5E8 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CARMIL2Q6F5E8 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CARMIL2Q6F5E8 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CARMIL2Q6F5E8 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CARMIL2Q6F5E8 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CARMIL2Q6F5E8 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CARMIL2Q6F5E8 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CARMIL2Q6F5E8 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CARMIL2Q6F5E8 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CARMIL2Q6F5E8 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CARMIL2Q6F5E8 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CARMIL2Q6F5E8 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CARMIL2Q6F5E8 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CARMIL2Q6F5E8 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CARMIL2Q6F5E8 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CARMIL2Q6F5E8 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CARMIL2Q6F5E8 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CARMIL2Q6F5E8 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CARMIL2Q6F5E8 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CARMIL2Q6F5E8 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CARMIL2Q6F5E8 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CARMIL2Q6F5E8 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CARMIL2Q6F5E8 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CARMIL2Q6F5E8 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CARMIL2Q6F5E8 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CARMIL2Q6F5E8 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CARMIL2Q6F5E8 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CARMIL2Q6F5E8 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CARMIL2Q6F5E8 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CARMIL2Q6F5E8 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CARMIL2Q6F5E8 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CARMIL2Q6F5E8 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CARMIL2Q6F5E8 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CARMIL2Q6F5E8 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CARMIL2Q6F5E8 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CARMIL2Q6F5E8 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CARMIL2Q6F5E8 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CARMIL2Q6F5E8 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CARMIL2Q6F5E8 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CARMIL2Q6F5E8 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CARMIL2Q6F5E8 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CARMIL2Q6F5E8 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CARMIL2Q6F5E8 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CARMIL2Q6F5E8 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CARMIL2Q6F5E8 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CARMIL2Q6F5E8 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CARMIL2Q6F5E8 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CARMIL2Q6F5E8 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CARMIL2Q6F5E8 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CARMIL2Q6F5E8 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CARMIL2Q6F5E8 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CARMIL2Q6F5E8 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CARMIL2Q6F5E8 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CARMIL2Q6F5E8 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CARMIL2Q6F5E8 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CARMIL2Q6F5E8 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CARMIL2Q6F5E8 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CARMIL2Q6F5E8 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CARMIL2Q6F5E8 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CARMIL2Q6F5E8 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CARMIL2Q6F5E8 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CARMIL2Q6F5E8 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CARMIL2Q6F5E8 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CARMIL2Q6F5E8 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CARMIL2Q6F5E8 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CARMIL2Q6F5E8 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CARMIL2Q6F5E8 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CARMIL2Q6F5E8 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CARMIL2Q6F5E8 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CARMIL2Q6F5E8 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CARMIL2Q6F5E8 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CARMIL2Q6F5E8 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CARMIL2Q6F5E8 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CARMIL2Q6F5E8 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CARMIL2Q6F5E8 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CARMIL2Q6F5E8 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CARMIL2Q6F5E8 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CARMIL2Q6F5E8 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CARMIL2Q6F5E8 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CARMIL2Q6F5E8 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms