Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

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Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.92□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC13.92□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC13.92□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.91□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
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C9orf135Q5VTT2 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.91□□□□□ -0.18
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C9orf135Q5VTT2 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
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C9orf135Q5VTT2 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C9orf135Q5VTT2 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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