Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTM2

AGAP9, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP9Q5VTM2 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
AGAP9Q5VTM2 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AGAP9Q5VTM2 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
AGAP9Q5VTM2 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AGAP9Q5VTM2 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
AGAP9Q5VTM2 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
AGAP9Q5VTM2 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AGAP9Q5VTM2 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
AGAP9Q5VTM2 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AGAP9Q5VTM2 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
AGAP9Q5VTM2 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
AGAP9Q5VTM2 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AGAP9Q5VTM2 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
AGAP9Q5VTM2 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AGAP9Q5VTM2 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
AGAP9Q5VTM2 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
AGAP9Q5VTM2 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AGAP9Q5VTM2 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AGAP9Q5VTM2 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AGAP9Q5VTM2 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
AGAP9Q5VTM2 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
AGAP9Q5VTM2 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
AGAP9Q5VTM2 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
AGAP9Q5VTM2 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
AGAP9Q5VTM2 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
AGAP9Q5VTM2 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
AGAP9Q5VTM2 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AGAP9Q5VTM2 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
AGAP9Q5VTM2 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
AGAP9Q5VTM2 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
AGAP9Q5VTM2 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
AGAP9Q5VTM2 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AGAP9Q5VTM2 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
AGAP9Q5VTM2 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
AGAP9Q5VTM2 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
AGAP9Q5VTM2 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
AGAP9Q5VTM2 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
AGAP9Q5VTM2 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
AGAP9Q5VTM2 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
AGAP9Q5VTM2 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
AGAP9Q5VTM2 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
AGAP9Q5VTM2 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
AGAP9Q5VTM2 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
AGAP9Q5VTM2 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
AGAP9Q5VTM2 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AGAP9Q5VTM2 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AGAP9Q5VTM2 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AGAP9Q5VTM2 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AGAP9Q5VTM2 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AGAP9Q5VTM2 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AGAP9Q5VTM2 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AGAP9Q5VTM2 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AGAP9Q5VTM2 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AGAP9Q5VTM2 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AGAP9Q5VTM2 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AGAP9Q5VTM2 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AGAP9Q5VTM2 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AGAP9Q5VTM2 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AGAP9Q5VTM2 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AGAP9Q5VTM2 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AGAP9Q5VTM2 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AGAP9Q5VTM2 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AGAP9Q5VTM2 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AGAP9Q5VTM2 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AGAP9Q5VTM2 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AGAP9Q5VTM2 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AGAP9Q5VTM2 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AGAP9Q5VTM2 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AGAP9Q5VTM2 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AGAP9Q5VTM2 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AGAP9Q5VTM2 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AGAP9Q5VTM2 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
AGAP9Q5VTM2 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AGAP9Q5VTM2 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AGAP9Q5VTM2 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AGAP9Q5VTM2 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AGAP9Q5VTM2 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AGAP9Q5VTM2 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AGAP9Q5VTM2 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AGAP9Q5VTM2 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AGAP9Q5VTM2 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AGAP9Q5VTM2 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AGAP9Q5VTM2 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AGAP9Q5VTM2 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AGAP9Q5VTM2 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
AGAP9Q5VTM2 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AGAP9Q5VTM2 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AGAP9Q5VTM2 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AGAP9Q5VTM2 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AGAP9Q5VTM2 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AGAP9Q5VTM2 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AGAP9Q5VTM2 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AGAP9Q5VTM2 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AGAP9Q5VTM2 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AGAP9Q5VTM2 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AGAP9Q5VTM2 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AGAP9Q5VTM2 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AGAP9Q5VTM2 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AGAP9Q5VTM2 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AGAP9Q5VTM2 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.7 ms