Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TDRD12Q587J7 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TDRD12Q587J7 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms