Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB6CQ53S08 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms