Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HSD17B12Q53GQ0 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms