Protein–RNA interactions for Protein: Q494R4

CCDC153, Coiled-coil domain-containing protein 153, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC153Q494R4 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC153Q494R4 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CCDC153Q494R4 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms