Protein–RNA interactions for Protein: Q2VYF4

LETM2, LETM1 domain-containing protein LETM2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETM2Q2VYF4 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LETM2Q2VYF4 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LETM2Q2VYF4 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LETM2Q2VYF4 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LETM2Q2VYF4 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LETM2Q2VYF4 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LETM2Q2VYF4 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LETM2Q2VYF4 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LETM2Q2VYF4 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LETM2Q2VYF4 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LETM2Q2VYF4 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LETM2Q2VYF4 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LETM2Q2VYF4 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LETM2Q2VYF4 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
LETM2Q2VYF4 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
LETM2Q2VYF4 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LETM2Q2VYF4 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LETM2Q2VYF4 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LETM2Q2VYF4 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LETM2Q2VYF4 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LETM2Q2VYF4 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LETM2Q2VYF4 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LETM2Q2VYF4 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
LETM2Q2VYF4 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LETM2Q2VYF4 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LETM2Q2VYF4 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LETM2Q2VYF4 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LETM2Q2VYF4 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LETM2Q2VYF4 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LETM2Q2VYF4 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LETM2Q2VYF4 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LETM2Q2VYF4 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LETM2Q2VYF4 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LETM2Q2VYF4 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LETM2Q2VYF4 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LETM2Q2VYF4 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LETM2Q2VYF4 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LETM2Q2VYF4 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LETM2Q2VYF4 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LETM2Q2VYF4 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LETM2Q2VYF4 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
LETM2Q2VYF4 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LETM2Q2VYF4 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LETM2Q2VYF4 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
LETM2Q2VYF4 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LETM2Q2VYF4 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
LETM2Q2VYF4 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LETM2Q2VYF4 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LETM2Q2VYF4 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LETM2Q2VYF4 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
LETM2Q2VYF4 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LETM2Q2VYF4 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LETM2Q2VYF4 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LETM2Q2VYF4 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LETM2Q2VYF4 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LETM2Q2VYF4 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LETM2Q2VYF4 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LETM2Q2VYF4 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LETM2Q2VYF4 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
LETM2Q2VYF4 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LETM2Q2VYF4 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LETM2Q2VYF4 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LETM2Q2VYF4 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LETM2Q2VYF4 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LETM2Q2VYF4 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LETM2Q2VYF4 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LETM2Q2VYF4 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LETM2Q2VYF4 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LETM2Q2VYF4 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LETM2Q2VYF4 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LETM2Q2VYF4 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LETM2Q2VYF4 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
LETM2Q2VYF4 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LETM2Q2VYF4 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LETM2Q2VYF4 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LETM2Q2VYF4 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LETM2Q2VYF4 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LETM2Q2VYF4 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
LETM2Q2VYF4 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LETM2Q2VYF4 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LETM2Q2VYF4 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LETM2Q2VYF4 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
LETM2Q2VYF4 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LETM2Q2VYF4 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LETM2Q2VYF4 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LETM2Q2VYF4 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LETM2Q2VYF4 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LETM2Q2VYF4 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LETM2Q2VYF4 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LETM2Q2VYF4 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
LETM2Q2VYF4 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LETM2Q2VYF4 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LETM2Q2VYF4 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LETM2Q2VYF4 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LETM2Q2VYF4 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LETM2Q2VYF4 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LETM2Q2VYF4 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LETM2Q2VYF4 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
LETM2Q2VYF4 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
LETM2Q2VYF4 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
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