Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 LINC00926-202ENST00000502027 2141 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLPPQ16740 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLPPQ16740 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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