Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDK4Q16654 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDK4Q16654 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PDK4Q16654 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDK4Q16654 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDK4Q16654 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDK4Q16654 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDK4Q16654 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDK4Q16654 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDK4Q16654 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDK4Q16654 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDK4Q16654 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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PDK4Q16654 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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PDK4Q16654 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDK4Q16654 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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PDK4Q16654 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDK4Q16654 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDK4Q16654 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDK4Q16654 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDK4Q16654 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDK4Q16654 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PDK4Q16654 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDK4Q16654 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDK4Q16654 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDK4Q16654 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDK4Q16654 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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PDK4Q16654 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
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PDK4Q16654 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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PDK4Q16654 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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PDK4Q16654 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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PDK4Q16654 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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PDK4Q16654 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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PDK4Q16654 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDK4Q16654 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDK4Q16654 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDK4Q16654 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDK4Q16654 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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PDK4Q16654 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDK4Q16654 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDK4Q16654 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68 ms