Protein–RNA interactions for Protein: Q16563

SYPL1, Synaptophysin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYPL1Q16563 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SYPL1Q16563 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms