Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NCOA1Q15788 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NCOA1Q15788 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NCOA1Q15788 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NCOA1Q15788 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NCOA1Q15788 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NCOA1Q15788 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NCOA1Q15788 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NCOA1Q15788 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NCOA1Q15788 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NCOA1Q15788 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NCOA1Q15788 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NCOA1Q15788 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NCOA1Q15788 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NCOA1Q15788 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NCOA1Q15788 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NCOA1Q15788 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NCOA1Q15788 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NCOA1Q15788 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NCOA1Q15788 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NCOA1Q15788 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NCOA1Q15788 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NCOA1Q15788 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NCOA1Q15788 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NCOA1Q15788 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NCOA1Q15788 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NCOA1Q15788 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NCOA1Q15788 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NCOA1Q15788 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NCOA1Q15788 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NCOA1Q15788 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NCOA1Q15788 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NCOA1Q15788 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
NCOA1Q15788 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
NCOA1Q15788 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
NCOA1Q15788 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
NCOA1Q15788 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NCOA1Q15788 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NCOA1Q15788 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NCOA1Q15788 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NCOA1Q15788 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NCOA1Q15788 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NCOA1Q15788 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
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NCOA1Q15788 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
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NCOA1Q15788 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NCOA1Q15788 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NCOA1Q15788 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NCOA1Q15788 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NCOA1Q15788 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NCOA1Q15788 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
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NCOA1Q15788 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NCOA1Q15788 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NCOA1Q15788 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
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NCOA1Q15788 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
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NCOA1Q15788 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
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NCOA1Q15788 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NCOA1Q15788 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NCOA1Q15788 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NCOA1Q15788 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NCOA1Q15788 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NCOA1Q15788 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NCOA1Q15788 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NCOA1Q15788 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NCOA1Q15788 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NCOA1Q15788 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NCOA1Q15788 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NCOA1Q15788 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NCOA1Q15788 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NCOA1Q15788 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NCOA1Q15788 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NCOA1Q15788 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NCOA1Q15788 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NCOA1Q15788 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NCOA1Q15788 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NCOA1Q15788 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NCOA1Q15788 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NCOA1Q15788 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NCOA1Q15788 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NCOA1Q15788 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NCOA1Q15788 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NCOA1Q15788 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
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