Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 MGA-212ENST00000619521 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms