Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SYCP1Q15431 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SYCP1Q15431 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SYCP1Q15431 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SYCP1Q15431 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SYCP1Q15431 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SYCP1Q15431 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SYCP1Q15431 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SYCP1Q15431 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SYCP1Q15431 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SYCP1Q15431 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SYCP1Q15431 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SYCP1Q15431 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SYCP1Q15431 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SYCP1Q15431 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SYCP1Q15431 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SYCP1Q15431 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SYCP1Q15431 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SYCP1Q15431 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SYCP1Q15431 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SYCP1Q15431 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SYCP1Q15431 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SYCP1Q15431 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SYCP1Q15431 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SYCP1Q15431 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SYCP1Q15431 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SYCP1Q15431 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SYCP1Q15431 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SYCP1Q15431 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SYCP1Q15431 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SYCP1Q15431 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SYCP1Q15431 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SYCP1Q15431 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SYCP1Q15431 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SYCP1Q15431 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SYCP1Q15431 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SYCP1Q15431 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SYCP1Q15431 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SYCP1Q15431 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SYCP1Q15431 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SYCP1Q15431 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SYCP1Q15431 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SYCP1Q15431 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SYCP1Q15431 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SYCP1Q15431 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SYCP1Q15431 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SYCP1Q15431 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SYCP1Q15431 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SYCP1Q15431 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SYCP1Q15431 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SYCP1Q15431 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SYCP1Q15431 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SYCP1Q15431 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SYCP1Q15431 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SYCP1Q15431 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SYCP1Q15431 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SYCP1Q15431 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SYCP1Q15431 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SYCP1Q15431 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SYCP1Q15431 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SYCP1Q15431 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SYCP1Q15431 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SYCP1Q15431 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SYCP1Q15431 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SYCP1Q15431 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
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SYCP1Q15431 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SYCP1Q15431 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SYCP1Q15431 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SYCP1Q15431 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SYCP1Q15431 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
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SYCP1Q15431 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SYCP1Q15431 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
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SYCP1Q15431 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SYCP1Q15431 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SYCP1Q15431 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SYCP1Q15431 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SYCP1Q15431 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SYCP1Q15431 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SYCP1Q15431 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SYCP1Q15431 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SYCP1Q15431 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SYCP1Q15431 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SYCP1Q15431 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SYCP1Q15431 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SYCP1Q15431 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SYCP1Q15431 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SYCP1Q15431 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SYCP1Q15431 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SYCP1Q15431 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SYCP1Q15431 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SYCP1Q15431 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SYCP1Q15431 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SYCP1Q15431 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SYCP1Q15431 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SYCP1Q15431 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SYCP1Q15431 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SYCP1Q15431 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
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