Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRKQ15262 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRKQ15262 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRKQ15262 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRKQ15262 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRKQ15262 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRKQ15262 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRKQ15262 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRKQ15262 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRKQ15262 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRKQ15262 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRKQ15262 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRKQ15262 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRKQ15262 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRKQ15262 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRKQ15262 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRKQ15262 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRKQ15262 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRKQ15262 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRKQ15262 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRKQ15262 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRKQ15262 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRKQ15262 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRKQ15262 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRKQ15262 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRKQ15262 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRKQ15262 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRKQ15262 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRKQ15262 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRKQ15262 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRKQ15262 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRKQ15262 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRKQ15262 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRKQ15262 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRKQ15262 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRKQ15262 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRKQ15262 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRKQ15262 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRKQ15262 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRKQ15262 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRKQ15262 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRKQ15262 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRKQ15262 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRKQ15262 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRKQ15262 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRKQ15262 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRKQ15262 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRKQ15262 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRKQ15262 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRKQ15262 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRKQ15262 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRKQ15262 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRKQ15262 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRKQ15262 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRKQ15262 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRKQ15262 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRKQ15262 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRKQ15262 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRKQ15262 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRKQ15262 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRKQ15262 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRKQ15262 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRKQ15262 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRKQ15262 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRKQ15262 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRKQ15262 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRKQ15262 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRKQ15262 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRKQ15262 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRKQ15262 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRKQ15262 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRKQ15262 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRKQ15262 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRKQ15262 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRKQ15262 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRKQ15262 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRKQ15262 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRKQ15262 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRKQ15262 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRKQ15262 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRKQ15262 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRKQ15262 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRKQ15262 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRKQ15262 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRKQ15262 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRKQ15262 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRKQ15262 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPRKQ15262 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRKQ15262 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRKQ15262 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRKQ15262 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRKQ15262 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRKQ15262 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRKQ15262 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRKQ15262 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRKQ15262 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRKQ15262 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRKQ15262 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRKQ15262 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPRKQ15262 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
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