Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
COL4A6Q14031 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
COL4A6Q14031 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
COL4A6Q14031 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
COL4A6Q14031 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
COL4A6Q14031 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
COL4A6Q14031 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
COL4A6Q14031 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
COL4A6Q14031 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
COL4A6Q14031 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
COL4A6Q14031 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
COL4A6Q14031 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
COL4A6Q14031 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
COL4A6Q14031 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
COL4A6Q14031 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
COL4A6Q14031 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
COL4A6Q14031 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
COL4A6Q14031 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
COL4A6Q14031 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
COL4A6Q14031 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
COL4A6Q14031 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
COL4A6Q14031 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
COL4A6Q14031 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
COL4A6Q14031 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
COL4A6Q14031 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
COL4A6Q14031 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
COL4A6Q14031 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
COL4A6Q14031 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
COL4A6Q14031 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
COL4A6Q14031 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
COL4A6Q14031 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
COL4A6Q14031 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
COL4A6Q14031 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
COL4A6Q14031 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
COL4A6Q14031 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
COL4A6Q14031 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
COL4A6Q14031 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
COL4A6Q14031 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
COL4A6Q14031 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
COL4A6Q14031 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
COL4A6Q14031 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
COL4A6Q14031 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
COL4A6Q14031 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
COL4A6Q14031 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
COL4A6Q14031 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
COL4A6Q14031 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
COL4A6Q14031 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
COL4A6Q14031 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
COL4A6Q14031 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
COL4A6Q14031 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
COL4A6Q14031 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
COL4A6Q14031 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
COL4A6Q14031 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
COL4A6Q14031 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
COL4A6Q14031 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
COL4A6Q14031 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
COL4A6Q14031 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
COL4A6Q14031 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
COL4A6Q14031 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
COL4A6Q14031 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
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COL4A6Q14031 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
COL4A6Q14031 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
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COL4A6Q14031 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
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COL4A6Q14031 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
COL4A6Q14031 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
COL4A6Q14031 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
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COL4A6Q14031 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
COL4A6Q14031 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
COL4A6Q14031 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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