Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNA1SQ13698 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNA1SQ13698 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNA1SQ13698 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNA1SQ13698 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNA1SQ13698 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNA1SQ13698 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNA1SQ13698 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNA1SQ13698 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNA1SQ13698 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNA1SQ13698 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNA1SQ13698 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNA1SQ13698 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNA1SQ13698 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNA1SQ13698 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNA1SQ13698 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNA1SQ13698 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNA1SQ13698 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNA1SQ13698 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNA1SQ13698 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNA1SQ13698 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNA1SQ13698 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNA1SQ13698 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CACNA1SQ13698 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CACNA1SQ13698 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CACNA1SQ13698 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CACNA1SQ13698 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CACNA1SQ13698 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CACNA1SQ13698 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CACNA1SQ13698 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CACNA1SQ13698 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CACNA1SQ13698 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CACNA1SQ13698 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CACNA1SQ13698 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CACNA1SQ13698 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CACNA1SQ13698 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CACNA1SQ13698 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CACNA1SQ13698 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CACNA1SQ13698 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CACNA1SQ13698 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CACNA1SQ13698 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CACNA1SQ13698 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CACNA1SQ13698 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CACNA1SQ13698 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CACNA1SQ13698 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CACNA1SQ13698 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CACNA1SQ13698 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CACNA1SQ13698 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CACNA1SQ13698 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CACNA1SQ13698 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CACNA1SQ13698 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CACNA1SQ13698 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CACNA1SQ13698 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CACNA1SQ13698 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CACNA1SQ13698 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CACNA1SQ13698 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CACNA1SQ13698 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CACNA1SQ13698 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CACNA1SQ13698 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
CACNA1SQ13698 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CACNA1SQ13698 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CACNA1SQ13698 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CACNA1SQ13698 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CACNA1SQ13698 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CACNA1SQ13698 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CACNA1SQ13698 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CACNA1SQ13698 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CACNA1SQ13698 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CACNA1SQ13698 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
CACNA1SQ13698 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms