Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Length 790 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH18Q13634 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDH18Q13634 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDH18Q13634 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDH18Q13634 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDH18Q13634 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDH18Q13634 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDH18Q13634 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDH18Q13634 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDH18Q13634 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDH18Q13634 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDH18Q13634 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDH18Q13634 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
CDH18Q13634 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDH18Q13634 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDH18Q13634 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH18Q13634 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH18Q13634 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH18Q13634 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH18Q13634 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH18Q13634 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH18Q13634 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH18Q13634 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH18Q13634 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH18Q13634 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH18Q13634 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH18Q13634 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH18Q13634 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH18Q13634 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH18Q13634 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH18Q13634 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH18Q13634 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH18Q13634 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH18Q13634 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH18Q13634 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH18Q13634 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH18Q13634 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH18Q13634 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH18Q13634 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH18Q13634 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH18Q13634 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH18Q13634 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH18Q13634 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH18Q13634 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH18Q13634 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH18Q13634 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH18Q13634 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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