Protein–RNA interactions for Protein: Q13609

DNASE1L3, Deoxyribonuclease gamma, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNASE1L3Q13609 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DNASE1L3Q13609 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DNASE1L3Q13609 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms