Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

Predictions only

Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
ATRQ13535 MIR5196-201ENST00000578146 115 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
ATRQ13535 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
ATRQ13535 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
ATRQ13535 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ATRQ13535 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
ATRQ13535 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
ATRQ13535 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ATRQ13535 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
ATRQ13535 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
ATRQ13535 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
ATRQ13535 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
ATRQ13535 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
ATRQ13535 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
ATRQ13535 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ATRQ13535 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ATRQ13535 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ATRQ13535 HIST1H1D-201ENST00000244534 666 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
ATRQ13535 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ATRQ13535 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ATRQ13535 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ATRQ13535 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
ATRQ13535 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC12.11□□□□□ -0.47
ATRQ13535 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ATRQ13535 INCA1-203ENST00000575780 1221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ATRQ13535 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC12.11□□□□□ -0.47
ATRQ13535 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
ATRQ13535 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
ATRQ13535 AC104333.4-201ENST00000632866 554 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
ATRQ13535 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ATRQ13535 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ATRQ13535 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
ATRQ13535 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ATRQ13535 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ATRQ13535 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ATRQ13535 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
ATRQ13535 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ATRQ13535 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
ATRQ13535 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
ATRQ13535 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ATRQ13535 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ATRQ13535 MC3R-201ENST00000243911 1084 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ATRQ13535 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
ATRQ13535 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ATRQ13535 AL606748.1-201ENST00000423919 655 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ATRQ13535 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ATRQ13535 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
ATRQ13535 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ATRQ13535 AC084752.1-201ENST00000509766 622 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
ATRQ13535 KRT16P3-202ENST00000580113 1012 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ATRQ13535 KRT16P1-203ENST00000581027 1012 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ATRQ13535 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
ATRQ13535 AL138720.1-201ENST00000629853 778 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ATRQ13535 AC233280.19-201ENST00000633223 136 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
ATRQ13535 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ATRQ13535 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ATRQ13535 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ATRQ13535 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
ATRQ13535 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ATRQ13535 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ATRQ13535 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ATRQ13535 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ATRQ13535 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ATRQ13535 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ATRQ13535 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ATRQ13535 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ATRQ13535 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ATRQ13535 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ATRQ13535 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ATRQ13535 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
ATRQ13535 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ATRQ13535 UROS-201ENST00000368774 744 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ATRQ13535 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
ATRQ13535 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ATRQ13535 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ATRQ13535 AC134312.2-201ENST00000563521 608 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ATRQ13535 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ATRQ13535 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ATRQ13535 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ATRQ13535 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ATRQ13535 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ATRQ13535 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ATRQ13535 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ATRQ13535 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ATRQ13535 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ATRQ13535 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ATRQ13535 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ATRQ13535 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ATRQ13535 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ATRQ13535 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ATRQ13535 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ATRQ13535 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
ATRQ13535 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
ATRQ13535 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ATRQ13535 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ATRQ13535 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ATRQ13535 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
ATRQ13535 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ATRQ13535 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ATRQ13535 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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