Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 AC073575.1-201ENST00000551125 596 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLN3Q13286 SATB1-AS1-227ENST00000625533 743 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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