Protein–RNA interactions for Protein: Q13049

TRIM32, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM32, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM32Q13049 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 AC120057.1-201ENST00000483947 663 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 ATP5L2-201ENST00000505920 799 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM32Q13049 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms