Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRDM2Q13029 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRDM2Q13029 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRDM2Q13029 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRDM2Q13029 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PRDM2Q13029 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PRDM2Q13029 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRDM2Q13029 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRDM2Q13029 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRDM2Q13029 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRDM2Q13029 LINC00969-257ENST00000625632 898 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRDM2Q13029 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRDM2Q13029 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRDM2Q13029 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRDM2Q13029 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRDM2Q13029 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRDM2Q13029 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PRDM2Q13029 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRDM2Q13029 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRDM2Q13029 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRDM2Q13029 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRDM2Q13029 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRDM2Q13029 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRDM2Q13029 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRDM2Q13029 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRDM2Q13029 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PRDM2Q13029 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRDM2Q13029 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRDM2Q13029 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRDM2Q13029 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRDM2Q13029 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRDM2Q13029 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRDM2Q13029 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRDM2Q13029 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRDM2Q13029 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRDM2Q13029 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRDM2Q13029 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRDM2Q13029 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRDM2Q13029 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRDM2Q13029 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PRDM2Q13029 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRDM2Q13029 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRDM2Q13029 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRDM2Q13029 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRDM2Q13029 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRDM2Q13029 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRDM2Q13029 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRDM2Q13029 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRDM2Q13029 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRDM2Q13029 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRDM2Q13029 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRDM2Q13029 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRDM2Q13029 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRDM2Q13029 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRDM2Q13029 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRDM2Q13029 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRDM2Q13029 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRDM2Q13029 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRDM2Q13029 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRDM2Q13029 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRDM2Q13029 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRDM2Q13029 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRDM2Q13029 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PRDM2Q13029 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PRDM2Q13029 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRDM2Q13029 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRDM2Q13029 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRDM2Q13029 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRDM2Q13029 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRDM2Q13029 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRDM2Q13029 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRDM2Q13029 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRDM2Q13029 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRDM2Q13029 TCERG1L-AS1-201ENST00000436942 472 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRDM2Q13029 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRDM2Q13029 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRDM2Q13029 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRDM2Q13029 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PRDM2Q13029 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRDM2Q13029 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRDM2Q13029 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PRDM2Q13029 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRDM2Q13029 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PRDM2Q13029 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PRDM2Q13029 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRDM2Q13029 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRDM2Q13029 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRDM2Q13029 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRDM2Q13029 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRDM2Q13029 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRDM2Q13029 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRDM2Q13029 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRDM2Q13029 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRDM2Q13029 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PRDM2Q13029 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRDM2Q13029 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRDM2Q13029 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRDM2Q13029 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRDM2Q13029 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PRDM2Q13029 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
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