Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GRIK3Q13003 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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